Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ssh3Q8K330 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms