Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
SbsnQ8CIT9 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbsnQ8CIT9 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 675.9 ms