Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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