Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spef2Q8C9J3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113 ms