Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K3

Srsf12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf12Q8C8K3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Srsf12Q8C8K3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms