Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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TtpaQ8BWP5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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TtpaQ8BWP5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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TtpaQ8BWP5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TtpaQ8BWP5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms