Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gtf3c4Q8BMQ2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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