Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ell3Q80VR2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ell3Q80VR2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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