Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc155Q80VJ8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc155Q80VJ8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms