Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Clec18aQ7TSQ1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Clec18aQ7TSQ1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Clec18aQ7TSQ1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Clec18aQ7TSQ1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Clec18aQ7TSQ1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Clec18aQ7TSQ1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Clec18aQ7TSQ1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clec18aQ7TSQ1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms