Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmed3Q78IS1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms