Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca2Q6DIC0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca2Q6DIC0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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