Protein–RNA interactions for Protein: Q64364

Cdkn2a, Tumor suppressor ARF, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2aQ64364 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cdkn2aQ64364 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cdkn2aQ64364 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cdkn2aQ64364 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Cdkn2aQ64364 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn2aQ64364 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn2aQ64364 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn2aQ64364 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn2aQ64364 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn2aQ64364 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn2aQ64364 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn2aQ64364 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn2aQ64364 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn2aQ64364 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn2aQ64364 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn2aQ64364 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn2aQ64364 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn2aQ64364 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn2aQ64364 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn2aQ64364 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn2aQ64364 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn2aQ64364 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn2aQ64364 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn2aQ64364 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cdkn2aQ64364 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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