Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms