Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hcfc1Q61191 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
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Hcfc1Q61191 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Hcfc1Q61191 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Hcfc1Q61191 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Hcfc1Q61191 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Hcfc1Q61191 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hcfc1Q61191 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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