Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp4Q60972 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.7 ms