Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Grik1Q60934 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Grik1Q60934 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Grik1Q60934 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Grik1Q60934 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Grik1Q60934 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Grik1Q60934 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Grik1Q60934 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Grik1Q60934 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Grik1Q60934 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Grik1Q60934 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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