Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm37396-201ENSMUST00000191827 1495 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn3Q60764 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms