Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sin3aQ60520 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sin3aQ60520 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms