Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynrgQ5SV85 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms