Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spire1Q52KF3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spire1Q52KF3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms