Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shank3Q4ACU6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank3Q4ACU6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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