Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm28047Q3US59 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm28047Q3US59 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm28047Q3US59 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm28047Q3US59 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm28047Q3US59 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm28047Q3US59 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Gm28047Q3US59 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm28047Q3US59 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Gm28047Q3US59 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm28047Q3US59 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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