Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Rmi2Q3UPE3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms