Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf3b2Q3UJB0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b2Q3UJB0 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms