Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hace1Q3U0D9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms