Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Prr27Q3SYJ2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Prr27Q3SYJ2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms