Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nlrp1aQ2LKU9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms