Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim71Q1PSW8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim71Q1PSW8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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