Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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ptchd1Q14B62 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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ptchd1Q14B62 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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ptchd1Q14B62 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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ptchd1Q14B62 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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ptchd1Q14B62 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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ptchd1Q14B62 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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ptchd1Q14B62 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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ptchd1Q14B62 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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ptchd1Q14B62 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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ptchd1Q14B62 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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ptchd1Q14B62 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ptchd1Q14B62 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
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