Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rpusd3Q14AI6 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rpusd3Q14AI6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rpusd3Q14AI6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rpusd3Q14AI6 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms