Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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VgfQ0VGU4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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VgfQ0VGU4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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VgfQ0VGU4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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VgfQ0VGU4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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VgfQ0VGU4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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VgfQ0VGU4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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VgfQ0VGU4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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VgfQ0VGU4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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VgfQ0VGU4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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VgfQ0VGU4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VgfQ0VGU4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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VgfQ0VGU4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms