Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rab42Q0PD08 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms