Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms