Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TrioQ0KL02 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms