Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MitfQ08874 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms