Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Prrx2Q06348 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrx2Q06348 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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