Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cab39Q06138 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms