Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grin2bQ01097 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms