Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PrcdQ00LT2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms