Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

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Length 612 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SeleQ00690 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms