Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Smn1P97801 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smn1P97801 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Smn1P97801 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Smn1P97801 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Smn1P97801 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Smn1P97801 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Smn1P97801 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smn1P97801 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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