Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smyd1P97443 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms