Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LystP97412 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LystP97412 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LystP97412 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LystP97412 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LystP97412 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LystP97412 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LystP97412 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LystP97412 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LystP97412 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
LystP97412 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LystP97412 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LystP97412 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
LystP97412 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LystP97412 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LystP97412 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LystP97412 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LystP97412 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LystP97412 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LystP97412 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LystP97412 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms