Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms