Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NfixP70257 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NfixP70257 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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NfixP70257 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NfixP70257 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NfixP70257 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms