Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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