Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms