Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TspoP50637 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TspoP50637 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
TspoP50637 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TspoP50637 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TspoP50637 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
TspoP50637 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
TspoP50637 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TspoP50637 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TspoP50637 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TspoP50637 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TspoP50637 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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