Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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SftpbP50405 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SftpbP50405 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpbP50405 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SftpbP50405 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SftpbP50405 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SftpbP50405 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SftpbP50405 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SftpbP50405 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SftpbP50405 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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SftpbP50405 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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SftpbP50405 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SftpbP50405 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SftpbP50405 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SftpbP50405 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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SftpbP50405 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpbP50405 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpbP50405 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SftpbP50405 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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